Em 3 de novembro de 1709, como consequência da Guerra dos Emboabas (1707-1709), que demonstrara a fragilidade do controle de Coroa Portuguesa sobre a região das recém-descobertas minas de ouro (visto que o governador da capitania de São Vicente residia na capitania do Rio de Janeiro — esta separada daquela em 1567), o ramo sul da antiga capitania de São Vicente, separada da do Rio de Janeiro, e a capitania de Santana foram fundidas e transformadas na Capitania de São Paulo e Minas do Ouro.A capitania recém-criada incorpora as seguintes vilas pré-existentes:
- Cananéia - Curitiba - Guaratinguetá - Iguape - Itanhaém - Jundiaí - Laguna - Mariana - Mogi das Cruzes - Paranaguá - Santos - São Francisco do Sul - São Paulo - São Vicente - Sorocaba - Taubaté - Ubatuba [0] Em 1709, como consequência da Guerra dos Emboabas, o território mineiro, então pertencente à Capitania de Itanhaém, foi juntado ao território da capitania de São Vicente,a qual foi extinta, sendo criada a Capitania de São Paulo e Minas de Ouro. Porém, a Capitania de Itanhaém continuou existindo por décadas ainda.[1]