A teoria mais plausível sobre os túneis secretos de Rio Claro diz que eles teriam sido construídos no século XVIII ou em meados do século XIX. O motivo dessa conclusão é que a residência do Barão de Porto Feliz, onde foram realizadas as primeiras escavações, foi construída em 1864.Também é importante ressaltar que outros prédios importantes da rede de túneis foram fundados ou reformados nesse período, como o caso da Igreja Matriz — reformada em 1869. Uma observação importante é que 25 locais dessa rede tiveram seus prédios destruídos e sobrepostos por outras obras de engenharia mais recentes.Resumindo, outras possíveis entradas ou passagens foram lacradas propositalmente ou escondidas por outras estruturas. Outro fato curioso de se comentar é que o assunto simplesmente sumiu do interesse público nos últimos anos e nenhum princípio de novas investigações teve início. Portanto, é difícil imaginar quando teremos resposta sobre esse bizarro mistério.