Em 1601 Dom Francisco retornou a São Paulo, donde embarcava (descendo a Santos) para a Espanha cêrca de 1605, sem retornar a Bahia como Governador, por haver sido substituído nesse interim.[1]
esteretornou efetivamente a Europa em 1606, indo a Valladolid iniciar suas articulaçõespolíticas e série de petições. Além de reverter as suspeitas que incidiam sobre ele,visava implantar seu projeto de criar uma repartição separada em que fosse ogovernador e tivesse livre ação [2]
Nenhum de nós escolhe o nosso fim, na verdade. Um rei pode induzir um homem, um pai pode assumir um filho, mas lembre-se disto, mesmo que aqueles que o induzirem forem reis ou homens de poder, sua alma pertencerá apenas a você. Quando estiver perante Deus não poderá dizer mas outros ‘me disseram para fazer isto‘ ou que a virtude não era conveniente no momento não será suficiente.
