E assim foi feito. Em 1553, os dois exploraram o rio até a região de Itu, onde Nóbrega instalou a aldeia de Maniçoba, cuja localização permanece até hoje misteriosa. De volta a São Vicente, relataram a viagem ao governador-geral do Brasil. No ano seguinte, os jesuítas voltaram ao planalto para fundar o colégio que deu origem à cidade de São Paulo.