O rei espanhol Felipe IV resolveu agir: a pedido do religioso espanhol Antônio Ruiz de Montoya, o monarca exigiu que Raposo Tavares fosse caçado a qualquer preço e colocado à disposição do Tribunal da InquisiçãoA cédula real, expedida em 16 de setembro de 1539, a ele serefere como o chefe da destruição. [A Presença Indígena na Formação do Brasil]

Numa carta de Philippe IV ao vice rei doPeru, marquez de Manoera, datada de Madrid, de16 de Setembro de 1639, dizia o monarcha quedesíde 1614 os vizinhos e moradores da villa deS. Paulo haviam realizado varias entradas pelaterra do Brasil a dentro, «como por el puerto dePatos y rio grande», onde acabava a demarcaçãode Portugal, prova de que talavam o território hojeriograndense do sul. ["As era das bandeiras" Afonso de Taunay p.91]

1. Dom Diogo do Rego e Meiidonça a 16 de setembro de 1639 é mencionado numa real cédula ao Vice-Rei do Perú, para remédio e castigo dos portugueses de Sáo Paulo, coin FulanoPonce (deve de ser Gabriel), Fiancisco Sançhez, Fernando Melgarejo, Sebastião de Peralta e outros de nomes sul-americanos, como antigos "vecinos", moradores do Paraguai e que serviam - de guias às entradas dos bandeirantes, devendo ser remetidos em ferros ao Conselho das jndias. [Revistado do IHGSP p.215]

Esse tipo de denúncia contra o bandeirante se acumulou ao longo da década de 1630, principalmente depois do episódio de Barueri, em 1633, que deixou claro que nem a excomunhão fazia os paulistas mudarem de atitude. Até que, finalmente, em 16 de setembro de 1639, o rei espanhol Felipe IV resolveu agir:

a pedido do religioso espanhol Antônio Ruiz de Montoya, o monarca exigiu que Raposo Tavares fosse caçado a qualquer preço e colocado à disposição do Tribunal da Inquisição. A ordem perdeu efeito, porém, logo no ano seguinte, quando Portugal recuperou sua independência. Ele escapou, mas outros cristãos-novos de São Paulo ainda seriam, no futuro, presos e queimados — caso de Theotonio da Costa, em 1686, e Miguel de Mendonça, em 1731. [aventurasnahistoria.uol.com.br]